More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2126 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 429 aa  867    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  53.46 
 
 		 427 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  53.7 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  53.46 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  49.42 
 
 		 427 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  50.24 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  49.17 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  42.41 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  41.2 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  41.69 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 428 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 478 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  45.19 
 
 		 432 aa  312  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  38.04 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  40.95 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  38.48 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.04 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 436 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 431 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.68 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 442 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 433 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 436 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  34.07 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  28.61 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  29.9 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 427 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  28 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30.42 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  30.42 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.42 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.42 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>