More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1509 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  93.03 
 
 		 445 aa  838    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  83.37 
 
 		 442 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 445 aa  893    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  50.57 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 430 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  33.82 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.3 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  32.77 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.47 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.14 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.47 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  29.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  29.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  27.54 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.36 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  31.71 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.71 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  31.95 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.07 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  30.18 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.73 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.19 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.82 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.03 
 
 		 440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  28.88 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.82 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>