More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2909 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  76.71 
 
 		 424 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 425 aa  851    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  73.18 
 
 		 424 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  70.82 
 
 		 424 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  71.76 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  70.59 
 
 		 424 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  71.53 
 
 		 425 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  57.92 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  57.35 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  56.5 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  54.82 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  54.98 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  54.5 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  54.03 
 
 		 424 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  55.45 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  54.65 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  53.21 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  43.46 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  34.16 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.91 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  32.17 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  35.23 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  34.78 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.63 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  34.24 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.83 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.83 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.56 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  31.05 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.51 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>