More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5633 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  79.02 
 
 		 429 aa  688    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  71.63 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  59.58 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  56.28 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  55.37 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  56.05 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  56.78 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  56.05 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  56.28 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  55.58 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  55.37 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  50.81 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  51.4 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  52.79 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  52.9 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 		 425 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.2 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  36.02 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 432 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.47 
 
 		 430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.47 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  37.43 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  37.43 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  38.24 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  37.43 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  36.96 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  35.15 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  37.53 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  36.8 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  34.54 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.78 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 		 433 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.92 
 
 		 468 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 435 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.17 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  36.52 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  36.66 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>