More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1917 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  75.3 
 
 		 424 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  100 
 
 		 424 aa  867    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  75.24 
 
 		 424 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  71.97 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  70.59 
 
 		 425 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  69.1 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  67.29 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  59.43 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  53.05 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  54.03 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  52.61 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  54.03 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  50.71 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  51.4 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 428 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 437 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.59 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.05 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  33.51 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  35.85 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.98 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.98 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.98 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  33.88 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.15 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.45 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  36.89 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  33.15 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  33.33 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  33.88 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  33.88 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.02 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.98 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>