More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6592 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  79.01 
 
 
424 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  78.3 
 
 
424 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
424 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  66.35 
 
 
444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  66.12 
 
 
444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  65.88 
 
 
425 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  66.12 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  63.06 
 
 
425 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  60.81 
 
 
424 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 
425 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  60.1 
 
 
431 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 
429 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  58.08 
 
 
429 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  59.58 
 
 
430 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  54.48 
 
 
425 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  53.92 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  55.45 
 
 
425 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  54.03 
 
 
424 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
424 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  55.19 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 
441 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  52.59 
 
 
424 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
425 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 
424 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 
424 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  48.82 
 
 
425 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
427 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
441 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
436 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.27 
 
 
449 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.82 
 
 
430 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.79 
 
 
430 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  33.94 
 
 
435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.55 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
435 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.31 
 
 
430 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  212  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
435 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
435 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
435 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.31 
 
 
430 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
435 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
425 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  39.35 
 
 
468 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  39.35 
 
 
468 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  39.35 
 
 
468 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
434 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
435 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
428 aa  209  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  35.38 
 
 
439 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.64 
 
 
435 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
437 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
437 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
436 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  38.52 
 
 
440 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.41 
 
 
426 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
428 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 
449 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  34.4 
 
 
426 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
428 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  36.8 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  34.4 
 
 
426 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
435 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
425 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
435 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.4 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
440 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
430 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
429 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.57 
 
 
438 aa  199  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.31 
 
 
439 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.83 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
435 aa  199  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
435 aa  196  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
441 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
431 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
435 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
429 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
428 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
435 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
428 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
426 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
436 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
431 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
428 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
429 aa  192  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>