More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0775 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
425 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  69.88 
 
 
444 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  69.65 
 
 
444 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  69.18 
 
 
425 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  68.94 
 
 
425 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  68.24 
 
 
444 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 
425 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  62.12 
 
 
431 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  63.06 
 
 
424 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  61.41 
 
 
424 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  60.94 
 
 
424 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  60.47 
 
 
424 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  57.41 
 
 
425 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  57.92 
 
 
425 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 
429 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  57.61 
 
 
429 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 
424 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 
427 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  52.48 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  52.96 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  56.28 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  54.82 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 
424 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 
424 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 
425 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
427 aa  305  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.73 
 
 
449 aa  226  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
436 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
433 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
435 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.26 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
430 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
428 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
437 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
441 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
430 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
435 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  32.17 
 
 
435 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  35.64 
 
 
430 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
435 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  33.64 
 
 
435 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
435 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
435 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
435 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
435 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.8 
 
 
439 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.11 
 
 
439 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
435 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
435 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 
435 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  35.09 
 
 
437 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.65 
 
 
430 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.65 
 
 
430 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.41 
 
 
430 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
435 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
437 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
432 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
430 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
435 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
434 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  35.28 
 
 
443 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
430 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  35.71 
 
 
468 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
431 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
435 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 
430 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  35.47 
 
 
468 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
426 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
421 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  37.09 
 
 
468 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
425 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
434 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
449 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
433 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
433 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
433 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
434 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.19 
 
 
431 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  35.99 
 
 
440 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
428 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
434 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
434 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
436 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
428 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
431 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
434 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.72 
 
 
438 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>