More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2946 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  862    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  56.4 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  57.11 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  56.64 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  56.64 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  54.72 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  53.92 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  52.49 
 
 		 424 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  51.31 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  52.84 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  50.71 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  53.21 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  50.71 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  51.17 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 427 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  36.3 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  36.38 
 
 		 431 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 441 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  35.84 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.72 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.72 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.72 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.72 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.72 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  33.71 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.49 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 432 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.26 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.65 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 437 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.5 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 434 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 429 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.64 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.77 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.72 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.54 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  34.49 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  34.34 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>