More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0567 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
435 aa  888    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
425 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
436 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
427 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
441 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 
441 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
425 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  31.46 
 
 
424 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
444 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
444 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
444 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.07 
 
 
424 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
429 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
424 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
424 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
424 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
425 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
425 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
431 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
429 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
425 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.26 
 
 
424 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
427 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
425 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
424 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
424 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
424 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
429 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  33.72 
 
 
461 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
434 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
428 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
430 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
436 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  26.3 
 
 
428 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  26.3 
 
 
428 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  29.6 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  29.6 
 
 
430 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  29.6 
 
 
430 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
425 aa  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
427 aa  152  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  28.68 
 
 
430 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.33 
 
 
428 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
428 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
430 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
433 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
428 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
433 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.1 
 
 
430 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
428 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.22 
 
 
440 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
433 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  28.46 
 
 
429 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  28.46 
 
 
429 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
428 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
428 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
426 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
433 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
433 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
432 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
428 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
442 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
428 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
428 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
428 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
422 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
422 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
430 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
651 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.55 
 
 
426 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
441 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
429 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
422 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
436 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
425 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
422 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
433 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>