More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4840 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
441 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
427 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.49 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  33.02 
 
 
424 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
428 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
425 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
424 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
425 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
425 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
424 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
436 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
425 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
436 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
436 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 
427 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
434 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
424 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
444 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
444 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
432 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
423 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
425 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
435 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
425 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
433 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
429 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  31.87 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.07 
 
 
433 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  29.1 
 
 
452 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
464 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
424 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.78 
 
 
430 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.78 
 
 
430 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
441 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.78 
 
 
430 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
429 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
428 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
466 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
434 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
425 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
443 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
499 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
424 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
442 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
441 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
445 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
426 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.3 
 
 
426 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
428 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.3 
 
 
426 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  29.3 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.3 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  29.3 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.11 
 
 
430 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
466 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  33.14 
 
 
430 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.54 
 
 
424 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.06 
 
 
426 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
424 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.06 
 
 
426 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
431 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
482 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
427 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
430 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.16 
 
 
428 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
433 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.16 
 
 
428 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
441 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
430 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  30.24 
 
 
430 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
447 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
430 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  31.64 
 
 
429 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
432 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
428 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
430 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.75 
 
 
430 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
464 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
430 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
428 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.65 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>