More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01621 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  937    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  38.41 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 464 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  37.28 
 
 		 472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 469 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 462 aa  239  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 499 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.56 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.33 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 427 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.42 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.72 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.82 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 435 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.34 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.11 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  32.58 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.41 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  30.47 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.65 
 
 		 426 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.84 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 426 aa  163  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.65 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  29.41 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.41 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.61 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.53 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  29.41 
 
 		 426 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>