More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4012 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 462 aa  928    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  83.41 
 
 		 463 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  66.3 
 
 		 466 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  63.04 
 
 		 464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  61.3 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  59.44 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  59.65 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  59.87 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  59.57 
 
 		 469 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  60.31 
 
 		 472 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  59.65 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  59.42 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  58.75 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  59.11 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  42.95 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 442 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  35.68 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.88 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 435 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.91 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.1 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.1 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.1 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.87 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.1 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.1 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.85 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.23 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 427 aa  153  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.17 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.15 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.03 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.64 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.34 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 430 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  28.32 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  30.7 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>