More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2980 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  893    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  31.78 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  34.51 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 427 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.83 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.68 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.63 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 479 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 471 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  33.09 
 
 		 472 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  32.71 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.92 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.92 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 473 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.92 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.53 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 423 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 435 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  29.6 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  31.55 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 436 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.75 
 
 		 440 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.52 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>