More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4114 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  93.44 
 
 		 427 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  864    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  67.92 
 
 		 427 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  68.4 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  68.16 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  73.07 
 
 		 427 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  57.75 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  59.25 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  45.39 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  42.96 
 
 		 428 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  42.13 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  44.83 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  38.22 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.86 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 436 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 433 aa  226  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  33.42 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  32.76 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.52 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.52 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 432 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.14 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.46 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>