More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5718 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  862    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  73.07 
 
 		 427 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  72.13 
 
 		 427 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  64.62 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  65.09 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  65.09 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  57.75 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  55.74 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  57.85 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  55.97 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  50.24 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  46.24 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  44.05 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  42.14 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  42.69 
 
 		 432 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  38.74 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  38.12 
 
 		 435 aa  246  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 431 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  35.51 
 
 		 430 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  34.85 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.24 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.78 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.26 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.78 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  34.26 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.78 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  34.26 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.78 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.78 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.41 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.23 
 
 		 428 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.17 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  32.74 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.67 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  32.7 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>