More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2412 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
431 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 
427 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  58.69 
 
 
427 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  55.92 
 
 
427 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 
427 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  58.51 
 
 
428 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  55.87 
 
 
427 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  55.63 
 
 
427 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 
427 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  55.97 
 
 
427 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  58.31 
 
 
427 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 
429 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 
440 aa  363  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 
428 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 
428 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 
428 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  43.51 
 
 
428 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 
478 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  44.23 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
428 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  42.21 
 
 
429 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  46.83 
 
 
432 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 
423 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
430 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
427 aa  243  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
436 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
436 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
436 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
431 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 
432 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
429 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
432 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  38.29 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
433 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 
428 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  39.75 
 
 
436 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
431 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  40.48 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
431 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
434 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
434 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
432 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
433 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
434 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  34.28 
 
 
424 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
423 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
429 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
442 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
439 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
425 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
435 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
436 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
425 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.63 
 
 
427 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
428 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
428 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
428 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.38 
 
 
427 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
429 aa  156  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
425 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
426 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.01 
 
 
427 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
433 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
424 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
445 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
429 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
445 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
432 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
428 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
427 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
428 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
425 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30 
 
 
426 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
428 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.9 
 
 
426 aa  149  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>