More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4014 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  55.69 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  55.45 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  55.42 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  57.85 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  49.41 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 423 aa  348  8e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  48.06 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  45.98 
 
 		 428 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  45.98 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  45.63 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  43.34 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  43.69 
 
 		 432 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 436 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  41.65 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 432 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  42.04 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.1 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.1 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.85 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  35.7 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.33 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  35.88 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.5 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  35.09 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.27 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  32.64 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.48 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>