More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3785 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  93.44 
 
 		 427 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  867    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  66.75 
 
 		 427 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  66.75 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  72.13 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  66.98 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  61.79 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  57.98 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  57.38 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  59.02 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  51.9 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  46.46 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  44.9 
 
 		 428 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  42.72 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  44.33 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  41.65 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 432 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 432 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  37.98 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.39 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 431 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  34.16 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  31.95 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.27 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.27 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 424 aa  170  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.08 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.85 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.37 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.82 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.85 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.6 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>