More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0897 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
428 aa  887    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  52.58 
 
 
428 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  52.82 
 
 
428 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 
428 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 
478 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  50.7 
 
 
428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  51.41 
 
 
428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  52.12 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 
427 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
427 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  39.52 
 
 
427 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  39.29 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 
427 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
427 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  38.62 
 
 
432 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 
429 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  39.07 
 
 
427 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 
423 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.22 
 
 
427 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
431 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
436 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
436 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
431 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
436 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
429 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  34.21 
 
 
435 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
431 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
427 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.56 
 
 
430 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
435 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
430 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
434 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
432 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
428 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
432 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
434 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
433 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
436 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
436 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
428 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
434 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
433 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
437 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
433 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
428 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
423 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
425 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
444 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
444 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
437 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.03 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  29.41 
 
 
428 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
433 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.41 
 
 
428 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
444 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
426 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
435 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
435 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
434 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
429 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
435 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  28.31 
 
 
438 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
435 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
434 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
433 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.55 
 
 
427 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
425 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  29.37 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
432 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
435 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  28.28 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  28.16 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
436 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
430 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>