More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1148 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  76.69 
 
 		 436 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  90.72 
 
 		 434 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  93.76 
 
 		 433 aa  828    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  47.9 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  38.29 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  38.04 
 
 		 427 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  35.2 
 
 		 427 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  37.63 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.54 
 
 		 430 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.8 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 427 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 431 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 427 aa  226  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 427 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  34.21 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 428 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 428 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  34.57 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  37.25 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.84 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.59 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.59 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.59 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.67 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.67 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.67 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  37.14 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  32.09 
 
 		 428 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  34.29 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  34.29 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.34 
 
 		 426 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  35.7 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.04 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  32.6 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.29 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>