More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2874 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  871    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 433 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  41.18 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 431 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 427 aa  276  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 431 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 427 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 434 aa  256  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 427 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  43 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 432 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 427 aa  249  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  39.28 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  39.02 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  40.21 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  38.05 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  38.89 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  37.5 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 428 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 423 aa  216  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  41.28 
 
 		 427 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.62 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 431 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.37 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.6 
 
 		 427 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  31.58 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.36 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.51 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.33 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 431 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.94 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  32.94 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.83 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  36.24 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.24 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  36.24 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  36.24 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.17 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.61 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.92 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.92 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.92 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.92 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.64 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.92 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.6 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>