More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3513 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  96.04 
 
 		 429 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  875    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  66.43 
 
 		 427 aa  591  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  64.95 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  65.48 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 		 478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  52.36 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  43.41 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 423 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  43.17 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  40.77 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  43.69 
 
 		 427 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.59 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  36.55 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  34.34 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 431 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 431 aa  206  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 436 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  29.4 
 
 		 428 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 428 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.4 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.61 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.25 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.85 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  30.25 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.91 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.15 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.15 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.15 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.28 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.15 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.15 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.91 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  32.97 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32.97 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>