More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5578 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  85.81 
 
 		 430 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  93.06 
 
 		 432 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 432 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  63.81 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  67.93 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  67.77 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  67.77 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  58.67 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  57.35 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  56.19 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 428 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  55.48 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  50.24 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  47.37 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 434 aa  269  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  39.47 
 
 		 427 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  39.23 
 
 		 427 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  42.27 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  42.52 
 
 		 427 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  37.56 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  36.6 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  36.34 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  36.64 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  34.69 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  34.49 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  34.03 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 428 aa  212  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.58 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.58 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  32.48 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.11 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>