More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4466 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 440 aa  869    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  52.38 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  52.62 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  52.86 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  49.66 
 
 		 431 aa  359  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  49.41 
 
 		 427 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  46.24 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  45.93 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 423 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  42.21 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  41.63 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  40.19 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 430 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  41.24 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  39.9 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  44.17 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  35.25 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  35.25 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  35.25 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  35.25 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  35.25 
 
 		 426 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.5 
 
 		 426 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.75 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.59 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 430 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.3 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  32.4 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.01 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.76 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.01 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.65 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.01 
 
 		 428 aa  156  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>