More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3646 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 432 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  81.63 
 
 		 434 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  58.14 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 		 445 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  54.04 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  55.22 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  41.04 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  38.55 
 
 		 424 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 427 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.81 
 
 		 430 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.58 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.58 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.58 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  38.93 
 
 		 433 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  35.92 
 
 		 424 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.71 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 427 aa  216  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 427 aa  209  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.26 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.26 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.4 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.63 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.87 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  34.31 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.8 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.25 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  34.86 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  34.62 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.61 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  32.03 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 427 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>