More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2389 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  852    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  75.23 
 
 		 429 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  90.65 
 
 		 428 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  66.36 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  56.9 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  58.37 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  58.37 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  54.12 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  57.55 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  53.57 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  46.62 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  46.38 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  39.95 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  39.95 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  41.6 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  40.5 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  43.16 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 427 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  38.29 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.5 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  39.59 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.49 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.1 
 
 		 427 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  37.6 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  35.05 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  35.05 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  38.58 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  33.49 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 428 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.51 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.28 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.87 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.28 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.02 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>