More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0214 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  96.96 
 
 		 428 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  97.9 
 
 		 428 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  96.5 
 
 		 478 aa  856    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  69.16 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  67.29 
 
 		 428 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  64.24 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  60.37 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  51.41 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  43.43 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  45.32 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  43.43 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  44.98 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 423 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  45.98 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  42.69 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  35.9 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  33.01 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  33.85 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  29.82 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.34 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.24 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.11 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 427 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 433 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.23 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 442 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.08 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.23 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 427 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.17 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.17 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.17 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>