More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2005 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  64.09 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  65.54 
 
 		 446 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  63.27 
 
 		 447 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  63.78 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  54.88 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  45.25 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  41.45 
 
 		 452 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 		 473 aa  309  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  39.1 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  31.91 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.64 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 435 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.38 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.5 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  31.32 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.84 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.83 
 
 		 435 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  32.91 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.4 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.4 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.4 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.4 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.03 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 425 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 424 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.26 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.93 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>