More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6224 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  83.66 
 
 		 469 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  65.27 
 
 		 479 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  69.78 
 
 		 464 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  83.44 
 
 		 471 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  68.89 
 
 		 464 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  978    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  69.28 
 
 		 473 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  84.51 
 
 		 472 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  84.96 
 
 		 471 aa  807    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 		 466 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  62.67 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  63.11 
 
 		 466 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  61.09 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  66.89 
 
 		 462 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  59.13 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  45.58 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 442 aa  319  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  37.33 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.25 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.41 
 
 		 426 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 440 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  33.41 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.18 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.44 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.54 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 425 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.65 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.66 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.73 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.1 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  31.1 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  29.57 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.74 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.12 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.22 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  31.1 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>