More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0153 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
436 aa  906    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
427 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
425 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
425 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
425 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
425 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
441 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  34.65 
 
 
424 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  34.4 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
425 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
444 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
425 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
444 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
424 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
444 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
441 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
424 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
425 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
427 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
441 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
424 aa  202  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
432 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.14 
 
 
424 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
424 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
430 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
437 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
434 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
437 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
434 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
430 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
435 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 
433 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  32.07 
 
 
427 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
445 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
434 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
433 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
445 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
429 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
442 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  31.44 
 
 
428 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.25 
 
 
437 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
429 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  31.19 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  29.68 
 
 
430 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  29.43 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
435 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  29.43 
 
 
430 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  28.93 
 
 
430 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  28.93 
 
 
430 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
427 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
430 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  31.47 
 
 
454 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
435 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
430 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
441 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
439 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
430 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.33 
 
 
435 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  29.64 
 
 
452 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  30 
 
 
430 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
435 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
429 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
435 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.19 
 
 
426 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
426 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.19 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.19 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.19 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.19 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.86 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>