More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6065 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  904    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  89.88 
 
 		 425 aa  787    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  96.37 
 
 		 441 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  56.71 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  56.24 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  56.24 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  56.03 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  51.88 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  50.7 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  53.15 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  51.17 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  52.35 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  42.06 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.29 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  36.99 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.28 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  36.99 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  38.54 
 
 		 430 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  38.29 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  38.14 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  38.05 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.7 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  32.04 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 425 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.19 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 427 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.1 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  37.33 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 429 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 428 aa  204  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  37.13 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  36.86 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  36.86 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.82 
 
 		 435 aa  199  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  38.32 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>