More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5016 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  73.18 
 
 		 425 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  84.2 
 
 		 424 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 424 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  79.25 
 
 		 424 aa  700    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  75.24 
 
 		 424 aa  663    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  75.3 
 
 		 424 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  72.51 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 		 425 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  56.26 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  52.72 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  52.37 
 
 		 424 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  52.84 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  50.11 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 435 aa  216  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.17 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.56 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  33.41 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  36.29 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  36.29 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.75 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.41 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 435 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.18 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.68 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.51 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  33.75 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.51 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.08 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  34.53 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 441 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>