More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5161 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  94.31 
 
 		 422 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  94.79 
 
 		 422 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  91.47 
 
 		 422 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 651 aa  1314    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  94.08 
 
 		 422 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  94.31 
 
 		 422 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  99.53 
 
 		 422 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  79.13 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  79.37 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  79.13 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  79.13 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  79.13 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  79.61 
 
 		 433 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  79.61 
 
 		 433 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  78.5 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  71.39 
 
 		 426 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  70.92 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  70.33 
 
 		 425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  96.55 
 
 		 526 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  88.51 
 
 		 526 aa  330  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  88.51 
 
 		 526 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  88.51 
 
 		 526 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  86.21 
 
 		 526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  85.06 
 
 		 526 aa  320  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 431 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 		 426 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.19 
 
 		 430 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  39.72 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  39.72 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  39.72 
 
 		 430 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  36.08 
 
 		 430 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 433 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 		 433 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 433 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 427 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 433 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 		 433 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  78.91 
 
 		 514 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  78.91 
 
 		 536 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 430 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  75.32 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  78.23 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  78.47 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  78.47 
 
 		 538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  78.47 
 
 		 538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  37.23 
 
 		 427 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 430 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  36.98 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 434 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 426 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 427 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  36.76 
 
 		 427 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.47 
 
 		 449 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  38.29 
 
 		 440 aa  244  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 428 aa  243  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 427 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 427 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  37.09 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 439 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 425 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 433 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  38.68 
 
 		 439 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 433 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.56 
 
 		 426 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  36.56 
 
 		 426 aa  238  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 426 aa  238  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  38.76 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  36.56 
 
 		 426 aa  238  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.56 
 
 		 426 aa  238  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  72.92 
 
 		 520 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 441 aa  237  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 428 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 428 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 426 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.64 
 
 		 426 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  38.76 
 
 		 468 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  37.66 
 
 		 438 aa  237  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.56 
 
 		 426 aa  237  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>