More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0378 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  91.47 
 
 
422 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
422 aa  842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  96.21 
 
 
422 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  95.97 
 
 
422 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  96.21 
 
 
422 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  94.79 
 
 
651 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  95.02 
 
 
422 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  78.4 
 
 
433 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  78.4 
 
 
433 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  78.88 
 
 
433 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  78.4 
 
 
433 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  78.88 
 
 
433 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  78.4 
 
 
433 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  78.64 
 
 
433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  78.64 
 
 
461 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  70.92 
 
 
426 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  69.98 
 
 
426 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  68.9 
 
 
425 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.75 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  39.81 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  39.81 
 
 
430 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  39.58 
 
 
430 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  36.96 
 
 
430 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
433 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
433 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
433 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
433 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
430 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
427 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
430 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  37.71 
 
 
427 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  36.97 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 
426 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
425 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
434 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  37.34 
 
 
427 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
449 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
427 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
427 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
434 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
433 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.35 
 
 
449 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
427 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  38.5 
 
 
440 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
425 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
427 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 
434 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 
434 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 
434 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
440 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
428 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 
427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 
437 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 
436 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  38.03 
 
 
433 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
439 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 
441 aa  239  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 
423 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
435 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
428 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
428 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
433 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
428 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
428 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
428 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
428 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.08 
 
 
426 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  38.89 
 
 
439 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
428 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  38.18 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  38.18 
 
 
468 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
428 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  35.85 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  37.92 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  37.88 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  37.78 
 
 
437 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  37.56 
 
 
438 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
431 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  34.72 
 
 
428 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
437 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  37.12 
 
 
431 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
428 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
433 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
431 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>