More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2011 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  888    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  57.43 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  54.11 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  54.46 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  53.63 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  53.16 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  52.47 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  50.57 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  54.67 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  54.67 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  54.44 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  51.26 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  51.49 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  53.4 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  52.11 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  51.88 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  51.88 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  50.94 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  53.5 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  52.82 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  52.58 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  52.82 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  49.3 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.36 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  47.18 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  49.42 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  51.31 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  42.06 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  45.96 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  44.04 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  46.88 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 		 435 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  42.93 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  44.42 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  45.67 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  44.8 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  42.25 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.25 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  44.29 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.33 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  42.25 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  46.06 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.02 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.02 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 428 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 428 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.02 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  42.39 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  42.86 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 430 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  41.78 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 431 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  45.58 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  42.66 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  42.66 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 426 aa  329  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 427 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 428 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 427 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>