More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2500 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 370 aa  750    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  50.96 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  50.54 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  51.12 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  50.14 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  47.35 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  44.96 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 377 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.89 
 
 		 377 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  46.61 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.48 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.48 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.81 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  47.02 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.11 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.04 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  23.01 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  23.01 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.42 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  23.01 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  23.5 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  23.5 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  23.5 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  24.52 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.05 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  22.99 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.3 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 416 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.9 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 960 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.03 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.2 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 983 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.44 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 984 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.44 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.47 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.13 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.44 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  27.32 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.64 
 
 		 425 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.61 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 812 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  28.35 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 815 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  28.25 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.87 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  28.05 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.23 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.41 
 
 		 434 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.27 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  28.09 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  23.56 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  25.14 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>