More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0817 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  100 
 
 		 367 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  90.96 
 
 		 367 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  81.14 
 
 		 366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  76.99 
 
 		 365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  76.42 
 
 		 365 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  76.14 
 
 		 365 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  76.14 
 
 		 365 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  70.56 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  71.75 
 
 		 363 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  69.43 
 
 		 364 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  68.86 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  50.14 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  47.03 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  44.29 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  41.27 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  41.9 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  40.39 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  29.1 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  29.38 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  29.38 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.58 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.1 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.51 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  28.81 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  32.97 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.89 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.3 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  28.34 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  28.61 
 
 		 371 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  28.61 
 
 		 371 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.84 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  28.61 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.07 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.07 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  28.07 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 374 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  32.97 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.34 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  31.29 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  28.07 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 373 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.18 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.1 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.96 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.2 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  32.58 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.7 
 
 		 382 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.68 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 		 652 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.01 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.35 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.69 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.78 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.2 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  26.21 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.94 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.94 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.45 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.94 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.43 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.71 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.4 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.01 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.64 
 
 		 411 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.21 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.34 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.75 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.22 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  29.61 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.02 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.02 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>