More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1340 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 375 aa  727    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  62.73 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  56.37 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  52.15 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  51.32 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  48.36 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  49.01 
 
 		 393 aa  298  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  49.33 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  48.27 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  50.41 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  46.72 
 
 		 349 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  48.63 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  41.58 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  47.15 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  42.97 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  44 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  42.71 
 
 		 411 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  42.71 
 
 		 405 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  44.59 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  40.43 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  41.76 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  42.54 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  41.67 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 450 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  39.68 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  43.3 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  38.7 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  39.38 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  44.13 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.17 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  39.4 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  34.97 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  43.23 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  39.42 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  40.17 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  39.66 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  39.66 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  39.66 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  35.34 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  39.37 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  35.16 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  38.54 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  39.82 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  39.53 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.57 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  36.75 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  30.34 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  33.98 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  34.31 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  36.2 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  32.83 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  33.88 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  34.18 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.29 
 
 		 652 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  31.25 
 
 		 652 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.53 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 		 666 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  32.81 
 
 		 1033 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.91 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  32.36 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.48 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  30.84 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.71 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  33.51 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.4 
 
 		 369 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  36.26 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.88 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.4 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.12 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.45 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.21 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.43 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.11 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.35 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.35 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  32.14 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.98 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  33.42 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.43 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.27 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.71 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.06 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  32.97 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 684 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  31.18 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.78 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  34.41 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.41 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  36.05 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.56 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>