231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0535 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
338 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
338 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
338 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  81.6 
 
 
338 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  76.2 
 
 
340 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  80.31 
 
 
342 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  49.1 
 
 
361 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  47.09 
 
 
342 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  47.42 
 
 
335 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  42.9 
 
 
375 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  43.75 
 
 
349 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  40.57 
 
 
404 aa  159  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  40.24 
 
 
375 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  39.65 
 
 
385 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  39.78 
 
 
382 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  40.91 
 
 
372 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  36.18 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  35.84 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  38.2 
 
 
391 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  40.28 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  38.55 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  34.15 
 
 
405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  36.13 
 
 
393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  32.66 
 
 
374 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.51 
 
 
384 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.77 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  34.11 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  32.99 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.31 
 
 
356 aa  109  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  32.61 
 
 
316 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  37.14 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.53 
 
 
411 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.19 
 
 
440 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  33.93 
 
 
360 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  34.04 
 
 
337 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  31.84 
 
 
388 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  34.44 
 
 
450 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 
365 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.46 
 
 
367 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  28.86 
 
 
367 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  32.58 
 
 
371 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  32.42 
 
 
338 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  31.35 
 
 
334 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  31.35 
 
 
334 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  32.05 
 
 
338 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.99 
 
 
1033 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 
369 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  29.67 
 
 
330 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
368 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
379 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  32.42 
 
 
338 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  31.6 
 
 
334 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  32.01 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  32.34 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  47.83 
 
 
389 aa  96.3  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  37.19 
 
 
395 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  33.53 
 
 
338 aa  95.9  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  32.03 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.12 
 
 
652 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.09 
 
 
401 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  34.82 
 
 
325 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  35.62 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.19 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
378 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  33.73 
 
 
377 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  30.93 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.6 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  30.38 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.09 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.06 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.07 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.99 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  32.31 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.67 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.33 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.46 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.86 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  38.1 
 
 
652 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.49 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.97 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>