More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0094 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 368 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  55.43 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  56.15 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  50.96 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  55.46 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  50 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  51.23 
 
 		 393 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  50.81 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  51.36 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  49.73 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  50.93 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  47.59 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  47.31 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  49.86 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  44.15 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  49.59 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  43.36 
 
 		 374 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  46.93 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  46.81 
 
 		 411 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  46.2 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  44.83 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  45.92 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  45.6 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  47.15 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  46.37 
 
 		 375 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  46.22 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  44.17 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  41.46 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  45.43 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  48.61 
 
 		 389 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  40.22 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  41.46 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  41.19 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  36.89 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  40.6 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  34.1 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.75 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  40 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  40.78 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  36.71 
 
 		 652 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.01 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  36.77 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  41.71 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  35.73 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  35.58 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  35.45 
 
 		 666 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  30.03 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  30.03 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 		 369 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  31.04 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.83 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.83 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  29.18 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  40.28 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  40.28 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  40.28 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.04 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  29.55 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  33.33 
 
 		 1033 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  34.45 
 
 		 684 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  37.63 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.42 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  36.67 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  40.56 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.33 
 
 		 652 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.7 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.32 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.17 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  37.75 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.62 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.62 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 419 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.9 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  36.54 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.71 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.66 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  28.82 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  28.82 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.12 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  28.82 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.12 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  32.39 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  28.82 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  28.82 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.13 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  28.41 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32.01 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.83 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>