More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0912 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 349 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  47.83 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  51 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  45.43 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  46.72 
 
 		 375 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  43.73 
 
 		 388 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  48.38 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  51 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  47.7 
 
 		 372 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  47.95 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  42.58 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  41.97 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  46.9 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 		 405 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  41.94 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  36.76 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  42.16 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  37.74 
 
 		 454 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  43.82 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  38.93 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  44.88 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  43.48 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  42.06 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  39.95 
 
 		 450 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  38.3 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  40.33 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  38.03 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  38.26 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  44.62 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  44.32 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  36.68 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  39.04 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  37.54 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  37.77 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.65 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  36.76 
 
 		 410 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  34.01 
 
 		 666 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.19 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  32.39 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  35.04 
 
 		 652 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.72 
 
 		 666 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  36.83 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  37.69 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  32.58 
 
 		 652 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  34.67 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  35.54 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  33.51 
 
 		 684 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  36.05 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  33.07 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.88 
 
 		 417 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.58 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  31.86 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.16 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  32.88 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 419 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.81 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  28.77 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.08 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.51 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.98 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.06 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.47 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  28.12 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  28.12 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  28.49 
 
 		 369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.8 
 
 		 1033 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.77 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.52 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.92 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  31.35 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  34.4 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.57 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.29 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  34.13 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.59 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.24 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.34 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.03 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  33.53 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  33.13 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  30.24 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  28.08 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>