More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0495 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
395 aa  740    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  56.59 
 
 
389 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  49.07 
 
 
372 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  43.9 
 
 
382 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  44.17 
 
 
375 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  43.49 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  44.8 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  44.2 
 
 
404 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  41.5 
 
 
440 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  41.03 
 
 
454 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  41.25 
 
 
411 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  43.13 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  42.78 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  44.39 
 
 
371 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  40.41 
 
 
391 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  41.78 
 
 
349 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  43.56 
 
 
393 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 
373 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  43.54 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  37.47 
 
 
374 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  45.6 
 
 
368 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  42.43 
 
 
401 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  39.3 
 
 
450 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  38.77 
 
 
405 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  39.49 
 
 
406 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  39.74 
 
 
375 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  37.6 
 
 
388 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  42.15 
 
 
342 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  31.76 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  40.62 
 
 
410 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  38.36 
 
 
360 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  38.81 
 
 
402 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  39.43 
 
 
389 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  38.52 
 
 
376 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  33.87 
 
 
652 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  39.23 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  36.27 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.63 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.82 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  38.8 
 
 
376 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  38.52 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  37.43 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  31.56 
 
 
666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  34.15 
 
 
371 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  36.46 
 
 
361 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  34.62 
 
 
684 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  31.27 
 
 
666 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  31.1 
 
 
652 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.77 
 
 
1033 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  39.34 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.21 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  37.5 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
380 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  38.19 
 
 
342 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
419 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.57 
 
 
367 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
363 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.61 
 
 
371 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 
367 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  31.03 
 
 
363 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.79 
 
 
367 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 
368 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
381 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.6 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
369 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
410 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.51 
 
 
369 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.13 
 
 
372 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  37.19 
 
 
338 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  37.19 
 
 
338 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  37.19 
 
 
338 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.86 
 
 
369 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  35.56 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.63 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.56 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.73 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.06 
 
 
355 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  32.09 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  27.75 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
484 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  24.8 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.52 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  30.68 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.14 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
353 aa  89  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>