More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00541 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  75.72 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  75.72 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  74.86 
 
 		 369 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.75 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  53.95 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  51.22 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  55.17 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  54.31 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  49.86 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  37.75 
 
 		 652 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 360 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  38.73 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  36.15 
 
 		 666 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  35.86 
 
 		 666 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  36.67 
 
 		 652 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  35.56 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  32.03 
 
 		 684 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  54.36 
 
 		 149 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.02 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.1 
 
 		 1033 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.35 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.19 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.73 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  28.46 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  28.46 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  28.18 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.2 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  28.18 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.37 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.18 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.61 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.1 
 
 		 440 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.79 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.2 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.13 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 		 375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.22 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.7 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  29.92 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.63 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  28.53 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  28.33 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  27.55 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  27.41 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  27.41 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  23.23 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  28.06 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  28.16 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.87 
 
 		 417 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.63 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.59 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  23.68 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  25.56 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  26.33 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  25.84 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  22.87 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.61 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  27.47 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.48 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  23.26 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  27.61 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  27.61 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  27.61 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.31 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  26.92 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  27.62 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  27.62 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  27.62 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>