More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2498 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  100 
 
 		 355 aa  710    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  67.53 
 
 		 371 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  67.61 
 
 		 371 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  58.91 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  58.33 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  58.62 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  50.29 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  49.71 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  49.71 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  49.71 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  43.21 
 
 		 652 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  39.49 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  42.21 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  40.96 
 
 		 666 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  40.68 
 
 		 666 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  71.14 
 
 		 149 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  36.69 
 
 		 684 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  35.18 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  38.4 
 
 		 652 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  39.72 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  34.56 
 
 		 1033 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  36.11 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  36.86 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  38.92 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.56 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  36.06 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  35.77 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.25 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  35.83 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  36.49 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  34.84 
 
 		 388 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  33.91 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.34 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.56 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.78 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.97 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.56 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.58 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  35.14 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.61 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  36.1 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  33.63 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 365 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.98 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  32.86 
 
 		 385 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  30.34 
 
 		 404 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.98 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.98 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.7 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  33.96 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.17 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.7 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.7 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.86 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.42 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  34.95 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.04 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.3 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.57 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  34.35 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  35.76 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  30.26 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  35.15 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  35.01 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.04 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.91 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.92 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.14 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  30.72 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.98 
 
 		 432 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  28.17 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.41 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  31.32 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.78 
 
 		 417 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  28.16 
 
 		 434 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>