More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01740 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 388 aa  746    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  44.88 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  39.67 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  39.95 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  41.11 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  40.05 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  38.33 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  36.27 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  37.09 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  38.62 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  37.03 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  37.67 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  37.78 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  35.37 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  37.47 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  36.24 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  37.93 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  39.07 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  32.83 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  39.07 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  36.73 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  35.28 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  33.94 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  34.87 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  34.35 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  34.64 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  34.8 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.91 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  35.34 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 		 666 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.53 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  37.64 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  29.16 
 
 		 666 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.52 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  27.7 
 
 		 652 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.01 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  31.48 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  31.48 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  31.48 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.97 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.23 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.23 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.85 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 316 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.69 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.41 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.04 
 
 		 371 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.53 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  30.31 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  28.81 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  32.77 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  27.68 
 
 		 684 aa  86.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.95 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  24.86 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.27 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.43 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.8 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.71 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.8 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  24.08 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  29.8 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  30.72 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.7 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  25.53 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  25.53 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.25 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.46 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  25.46 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  25.53 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.53 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.23 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>