More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0989 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  100 
 
 
404 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  55.04 
 
 
382 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  53.63 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  48.59 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  51.64 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  48.04 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  51.36 
 
 
372 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  49.31 
 
 
393 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  50.55 
 
 
385 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  52.46 
 
 
368 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  50.28 
 
 
398 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  45.04 
 
 
349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  42.82 
 
 
374 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  46.38 
 
 
392 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  41.29 
 
 
405 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  37.47 
 
 
454 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  44.23 
 
 
401 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  45.2 
 
 
375 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  44.2 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  42.86 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  41.29 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  41.02 
 
 
411 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  43.43 
 
 
335 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  38.92 
 
 
450 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  41.14 
 
 
371 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  39.61 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  39.33 
 
 
402 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  36.6 
 
 
652 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  44.59 
 
 
389 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  41.71 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 
376 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  34.72 
 
 
356 aa  182  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  33.15 
 
 
367 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  43.23 
 
 
338 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  41.93 
 
 
340 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  35.47 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  42.77 
 
 
342 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  36.71 
 
 
378 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  39.3 
 
 
375 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  36.44 
 
 
371 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  35.37 
 
 
388 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
379 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  31.76 
 
 
666 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  31.76 
 
 
666 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  40.17 
 
 
361 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  31.77 
 
 
365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  37.06 
 
 
371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  36.14 
 
 
368 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  39.83 
 
 
338 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  39.83 
 
 
338 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  39.83 
 
 
338 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  32.32 
 
 
1033 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.56 
 
 
355 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  43.1 
 
 
342 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  40.65 
 
 
376 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  31.18 
 
 
367 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.59 
 
 
369 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  35.03 
 
 
375 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.52 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.03 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.9 
 
 
367 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  40.38 
 
 
376 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.03 
 
 
369 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  34.5 
 
 
652 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  37.57 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
419 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.92 
 
 
367 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  28.9 
 
 
369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  34.46 
 
 
684 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
378 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.86 
 
 
371 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 
369 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  37.4 
 
 
385 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.33 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.28 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 
369 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  33.05 
 
 
368 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.78 
 
 
417 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.72 
 
 
386 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
380 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  29.67 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  28.05 
 
 
369 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  28.05 
 
 
369 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  34.18 
 
 
361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  27.45 
 
 
372 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  28.12 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  28.12 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  32.78 
 
 
372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
365 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.84 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.2 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  32.29 
 
 
363 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  31.02 
 
 
367 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 
365 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.88 
 
 
367 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>