More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28291 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  100 
 
 
371 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  67.49 
 
 
371 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  62.5 
 
 
386 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  67.8 
 
 
355 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  64.08 
 
 
367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  63.51 
 
 
367 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  54.34 
 
 
367 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  52.45 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  52.31 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  52.6 
 
 
369 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 
379 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  43.59 
 
 
360 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  43.3 
 
 
652 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  40.4 
 
 
367 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  40.79 
 
 
666 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  40.51 
 
 
666 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  37.85 
 
 
652 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  38.15 
 
 
684 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  67.79 
 
 
149 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  38.79 
 
 
382 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  32.51 
 
 
1033 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  35.16 
 
 
374 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.98 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  38.16 
 
 
401 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  35.99 
 
 
440 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  35.29 
 
 
405 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  35.25 
 
 
404 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  36.88 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.27 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  35.44 
 
 
411 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  35.94 
 
 
392 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  35.44 
 
 
391 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  35.31 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  37.96 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.88 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  32.29 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  34.72 
 
 
335 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 
375 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.59 
 
 
376 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  34.4 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  37.77 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 
349 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.2 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  36.91 
 
 
404 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.3 
 
 
361 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
367 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  34.47 
 
 
393 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.25 
 
 
363 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.37 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
376 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  36.94 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.36 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  34.87 
 
 
406 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.9 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
360 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  32.13 
 
 
385 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
380 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  28.95 
 
 
372 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  29.71 
 
 
363 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
363 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.78 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.91 
 
 
369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
365 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.39 
 
 
369 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  34.78 
 
 
402 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.07 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.34 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.07 
 
 
369 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.07 
 
 
369 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.07 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
365 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.39 
 
 
367 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
365 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  30.16 
 
 
361 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.79 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  32.63 
 
 
398 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.38 
 
 
369 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 
342 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.66 
 
 
378 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.92 
 
 
372 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.14 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  32.7 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.1 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  31.01 
 
 
338 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.91 
 
 
432 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>