More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00541 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  100 
 
 
386 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  65.52 
 
 
367 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  65.52 
 
 
367 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  62.53 
 
 
371 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  59.62 
 
 
371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  58.4 
 
 
355 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.49 
 
 
367 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.62 
 
 
369 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.91 
 
 
369 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  55.49 
 
 
369 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 
379 aa  258  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  39.62 
 
 
652 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  40.51 
 
 
367 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  38.53 
 
 
360 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  38.73 
 
 
652 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  37.02 
 
 
666 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  36.32 
 
 
684 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  36.74 
 
 
666 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  63.09 
 
 
149 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  34.43 
 
 
365 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  37.22 
 
 
382 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  35.17 
 
 
374 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  32.35 
 
 
1033 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.95 
 
 
392 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  32.2 
 
 
405 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.39 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 
440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.91 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  34.37 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 
368 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  30.73 
 
 
391 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  31.11 
 
 
404 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 
401 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  32.69 
 
 
384 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
376 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 
375 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.7 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.27 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.06 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  27.95 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  30 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.06 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.76 
 
 
378 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 
369 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  27.79 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.89 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.02 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 
388 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  29.25 
 
 
363 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
363 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.54 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.2 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.47 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.2 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.47 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  27.06 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.5 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
367 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 
404 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.65 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  27.95 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  26.2 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.93 
 
 
369 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  27.98 
 
 
361 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 
385 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.79 
 
 
367 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25 
 
 
372 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
366 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.21 
 
 
410 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  32.29 
 
 
368 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
365 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.32 
 
 
402 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  27.39 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  26.68 
 
 
395 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.16 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  28.65 
 
 
340 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.14 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.14 
 
 
371 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  24.6 
 
 
454 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.62 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.14 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 
338 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>