More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2406 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
379 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  47.23 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  47.18 
 
 
652 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  48.84 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  48.31 
 
 
652 aa  301  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  46 
 
 
666 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  45.71 
 
 
666 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  43.34 
 
 
684 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  44.51 
 
 
371 aa  255  8e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  41.03 
 
 
367 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  40.74 
 
 
367 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  43.3 
 
 
371 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  40.22 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  38.68 
 
 
367 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  37.43 
 
 
369 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  37.14 
 
 
369 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  37.43 
 
 
369 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  42.3 
 
 
355 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  36.18 
 
 
365 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  36.45 
 
 
1033 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  38.13 
 
 
382 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.4 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.4 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  31.13 
 
 
369 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 
369 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  31.4 
 
 
369 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  30.85 
 
 
369 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.42 
 
 
369 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 
369 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 
369 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  31.13 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  31.13 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  36.39 
 
 
375 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  36.65 
 
 
376 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  37.43 
 
 
374 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  35.63 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  38.76 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.7 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  37.12 
 
 
373 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
371 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  36.15 
 
 
384 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  36.34 
 
 
392 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  33.68 
 
 
440 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  35.67 
 
 
349 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  35.7 
 
 
404 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  37.3 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.98 
 
 
411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  36.48 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  32.76 
 
 
375 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  35.79 
 
 
360 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  34.07 
 
 
388 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
376 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  32.17 
 
 
372 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  36.28 
 
 
376 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  33.75 
 
 
402 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  35.99 
 
 
376 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.7 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.97 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  33.86 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  31.87 
 
 
363 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
363 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31 
 
 
368 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  33.72 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  41.53 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
367 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  42.08 
 
 
404 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.46 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.72 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.32 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.39 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  31.59 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  35.97 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
365 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
365 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  42.56 
 
 
365 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
377 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.91 
 
 
361 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
380 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  33.86 
 
 
406 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
365 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  33.16 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03391  hypothetical protein  48.99 
 
 
149 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.553612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.14 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.63 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 
338 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  30.6 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.51 
 
 
371 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  32.86 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  32.95 
 
 
316 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
377 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>