More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0197 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 342 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  86.05 
 
 		 338 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  80.31 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  80.31 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  80.31 
 
 		 338 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  77.58 
 
 		 340 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  48.65 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  50 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  44.22 
 
 		 375 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  46.36 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  44.44 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  42.82 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  42.47 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  40.17 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  40.4 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  41.36 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  39.38 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  38.92 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  41.74 
 
 		 398 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  36.69 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.28 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  36.49 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  38.46 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  40.56 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  37.31 
 
 		 393 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  34.94 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  33.9 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  37.43 
 
 		 450 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  35.28 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  33.44 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  33.44 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.72 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  33.12 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.13 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  33.5 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  33.67 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  33.82 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  34.03 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  33.53 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  35.29 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  36.19 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.98 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  32.58 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  38.19 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  34.29 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.09 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.83 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  33.54 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  34.9 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.43 
 
 		 1033 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  32.06 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  32.5 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  35.11 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  36.74 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  31.71 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  43.68 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.27 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  32.67 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.27 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  32.39 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.78 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 410 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  38.82 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  25.07 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.44 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.65 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  23.7 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  23.7 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  30.84 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.6 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  29.91 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.11 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>